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SABIA

System for Automated Bacterial Integrated Annotation
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SABIA é uma nova ferramenta desenvolvida para a montagem e anotação de genomas procariotas (Bioinformatics Nov 2004 1; 20 (16): 2832-3.). Ele executa tarefas automáticas de análise de montagem, identificação de ORFs e análise de regiões extragênicas. O sistema integra domínios públicos e programas recentemente desenvolvidos capazes de lidar com vários tipos de bancos de dados sendo portável para diferentes sistemas operacionais. Esses programas interagem com a maioria das ferramentas de bioinformática e bancos de dados conhecidos: Glimmer, Genemark, tRNAScan-SE, os programas da família BLAST, InterPro, COG, Kegg, PSORT, GO, RBSFinder e também pode ser usado para identificar vias metabólicas. O SABIA foi desenvolvido pelo Laboratório de Bioinformática (LABINFO / LNCC) e tem sido utilizado em vários projetos genoma.

Mais informações no site http://www.sabia.lncc.br

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