Disciplinas

Pós graduação

Bioinformática I: Banco de dados do ponto de vista biológico

LNCC

Ementa: Banco de dados de sequências de nucleotídeos (NCBI: GenBank, DDBJ e ENA/EMBL). Banco de dados de sequências de proteínas (NCBI-nr: RefSeq e UniProt). Banco de dados de motivos e domínios protéicos (PROSITE, PFAM, InterPro). Banco de dados de estrutura de proteínas (PDB). Banco de dados funcionais e metabólicos (KEGG, COG, GO) entre outros. Consulta e analise de dados em banco de dados.

 

Pré-Requisitos: Conhecimento em Biologia Molecular e alinhamento de sequências.

 

Referências:

  1. NCBI/GenBank: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
  2. DDBJ: http://www.ddbj.nig.ac.jp/
  3. ENA/EMBL: http://www.ebi.ac.uk/ena/
  4. UniProt: http://www.uniprot.org/
  5. Prosite: http://prosite.expasy.org/
  6. PFAM: http://pfam.xfam.org/
  7. InterPro: http://www.ebi.ac.uk/interpro/
  8. CATH: http://www.cathdb.info/
  9. SCOP2: http://scop2.mrc-lmb.cam.ac.uk/
  10. PDB: http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do
  11. KEGG: http://www.genome.jp/kegg/
  12. COG: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/COG/
  13. GO: http://www.geneontology.org/GO.database.shtml

 

  • GA-047
  • Curso

    Modelagem Computacional
  • Período

    31 de janeiro a 08 de fevereiro de 2019
  • Créditos

    03
  • Carga horária

    36h
  • Professores

    Luciane P. Ciapina, Marisa F. Nicolás, Reinaldo Bellini, Luis Willian Arge e Joseane Carvalho
  • Número de alunos

    20
  • Local das aulas

    LNCC
  • Programa

    Download do programa

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