Disciplinas

Pós graduação

Introdução à Biologia Computacional e Bioinformática

LNCC

Ementa: Este curso visa desenvolver com o estudante a capacidade de elaborar soluções matemáticas e computacionais para questões biológicas e moleculares. Será apresentada uma visão histórica do surgimento da biologia computacional, suas aplicações e desafios. Diferentes processos biológicos serão abordados com o desenvolvimento de algoritmos – levando em conta a sua complexidade – para a análise e geração de dados de interesse. A familiarização com distribuições Linux, linhas de comando, terminais e linguagem de programação (Perl ou Phyton) incluem-se nesta ementa a fim de dar suporte computacional prático às tarefas dos alunos. Bancos de dados e arquivos estruturados também serão apresentados, assim como ferramentas web, locais e pipelines. Em suma, este curso tem a intenção de abranger em largura a área da biologia computacional e bioinformática, fornecendo aos seus estudantes uma visão geral dessa ciência, estimulando o casamento entre algoritmos e técnicas com significado biológico.

 

Pré-Requisito: Conhecimento em biologia molecular

 

Referências:

 

  1. Neil, C. J.; Pavel A. P.; An introduction to bioinformatics algorithms. MIT press, 2004;
  2. Zaha, A.; Ferreira, H. B.; Passaglia, L. M. P.; Biologia Molecular Básica. 5ª edição. Porto Alegre: Artmed, 2014.
  3. Verli, H. et al.; Bioinformática da Biologia à flexibilidade molecular. Porto Alegre, 2014.
  4. Perl: Beginning Perl for Bioinformatics. (Download: http://it-ebooks.info/book/284/)
  5. Bioperl: http://oreilly.com/catalog/mperlbio/chapter/ch09.pdf
  6. Introdução a Progromação com Python – Nilo Coutinho – 2010 – editora novatec
  7. Ebook dive into python (http://www.diveintopython.net/)
  8. Comunidade pythonbrasil (python-brasil@googlegroups.com)
  9. Biopython http://biopython.org/wiki/Getting_Started
  • GB-203
  • Curso

    Modelagem Computacional
  • Período

    21 a 25 de janeiro de 2019
  • Créditos

    03
  • Carga horária

    36h
  • Professores

    Luis Willian P. Arge e Reinaldo Bellini
  • Número de alunos

    20
  • Local das aulas

    LNCC
  • Programa

    Download do programa

Listar disciplinas

    name) == $wp_query->query_vars['tag']){ $classActive = ' class="active"'; } echo '
  • ' . $tag->name.'
  • '; } ?>