Unidade de Genômica Computacional Darcy Fontoura de Almeida (UGCDFA)

Sequenciamentos

Amostras já sequenciadas nas plataformas da Unidade de Genômica Computacional Darcy Fontoura de Almeida
Conteúdo



454

Genomas

Bradyrhizobium japonicum PAC7 [SEMIA 5080]
Bradyrhizobium elkani 29W [SEMIA 5019]
Bradyrhizobium japonicum 5079
Trypanosoma cruzi Dm28
Metarhizium anisopliae
Crithidia deanei
Azospirillum amazonense
Candidatus Magnetoglobus multicellularis
Klebsiella pneumoniae
Blastochritidia culicis
Trypanosoma cruzi CL-14
Trypanosoma rangeli
Mycobacterium avium
BACs de cana de açúcar
Xylella fastidiosa u24d [XF1]
Xylella fastidiosa j1a12 [XF3]
Xylella fastidiosa fb#7 [XF4]
Zygosaccharomyces bailii
Fonsecaea pedrosoi
schenckii Sporothrix1099-18
Pool plasmídeos/formideos
Bradyrhizobium elkani 587
Burkholderia phenoliruptrix BR3459a
Sporothrix brasiliensis 5110
Blastocladiella emersonii
Staphylococcus aureus GV88
Staphylococcus aureus Be62
Staphylococcus aureus BMB9393
Staphylococcus aureus GV51
Spathaspora arboriae
Hypocnemis cantator
Pyriglena leucoptera
Bactéria magnetotática BW-1
Bactéria magnetotática SS-5
Cladophialophora carrionii KSF
Staphylococcus aureus HC551
Staphylococcus aureus HC1335
Staphylococcus aureus HC1340
Staphylococcus aureus GV69
Leptospira interrogans
Tritrichomonas foetus
Fonsecae brasiliensis
Ave 15591
Ave 74_56
Coco Itaipu
Bactéria magnetotática MV-1
Trypanosoma cruzi Y
Trypanosoma cruzi Arequipa
Trypanosoma cruzi Colombiana

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Metagenomas

NE Parque das Dunas (PD)
NE João Camara (JC)
NE Rio Judiaí (JD)
NE Jaguaribe (JA)
Bactérias aquáticas do Rio Solimões
Solo de Mata Atlântica do Rio Cubatão
NE Solo 2 (JC2)
NE DNA esponja (JC3)
NE Solo Cariri (S1E)
NE Timonha (TI)
Intestino do Caramujo
NE Coco
NE EST
NE MAR
NE PAC
Mangue 1B
Mangue 2B
NE MUC+PEC
Esgoto Hospitalar HMC 1 e 2
Esgoto hospitalar HUPE 1 e 2
Água do mar Arraial 1 e 2
Água da represa de marimbondo
Plantio convencional com rotação de cultura
Plantio convencional com sucessão de culturas
Plantio direto com rotação de cultura
Plantio direto com sucessão de culturas
Solo de 6 pontos de área de floresta (não impactada) da Fazenda Rio Preto
Solo de 6 pontos de área de pastagem (impactada) da Fazenda Rio Preto
Água de superfície do córrego São Pedro (JF/MG) área não urbanizada, não impactada.
Água de superfície do córrego São Pedro (JF/MG) área urbanizada, impactada.
Solo Ponta Grossa cultivar convencional
Solo Ponta Grossa transgênico
Solo Londrina cultivar convencional
Solo Londrina transgênico
Intestino de lagarta
Pulmão de Porco Doente
Pulmão de Porco Sadio

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Transcriptomas

Anopheles darlingi
Copaiba
Serpentes
Seringueira Pbi+t
Seringueira MDF180i
Seringueira MDF180t
Seringueira F4542i
Seringueira F4542t
Seringueira PA31i
Trigo Controle e Inoculado
Seringueira PA31t
Papagaio
Staphylococcus aureus
Klebsiella pneumoniae ATCC, KPN, 42039 e 8909
Mycoplasma hyopneumoniae
Mycoplasma flocculare
Mycoplasma hyorhinis
Linhagens celulares humanas
Amostras de pacientes com câncer de reto (normal, tumor e metástase)
Pseudomanas aeruginosa
Acinetobacter baumanii

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Amplicons

Micro RNA 3.10
Micro RNA 1.4C18
16S de microbiota bucal
Vírus H1N1
16S de bactérias de solo da Península Keller, Antártica

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Linhagens celulares

HCT116
SW480
Captura Câncer RL2 UACC893
Captura Câncer HCC202
Captura Câncer HCC1954
Câncer de Mama (capturas linhagens HCC1954/1954BL)
Câncer de Mama (linhagens HCC1954/1954BL)

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Ion PGM

Genomas

Rhizobium leucaenae CPAO29.8
Rhizobium leucaenae CFN299
Klebsiella pneumoniae
Pseudomonas aeruginosa
Staphylococcus aureus
Plasmodium vivax
Actinobacillus pleuropneumoniae

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Metagenomas

Aspirado Nasofaríngeo- Merrieux

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Ion Proton

Genomas

Trypanosoma cruzi Y
Trypanosoma cruzi Arequipa
Trypanosoma cruzi Colombiana
BbMT1
Pseudomonas aeruginosa
Staphylococcus aureus

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Metagenomas

Consórcio de bactérias

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Transcriptomas

Tecido normal de paciente com câncer de reto
Metarhizium anisopliae

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Rodapé